在浩瀚的太平洋深处，有一座神秘的小岛，小岛中心某处藏有一簇能量强大的光源，可以赋予人以超凡之力。为了防止光源被人类发现，小岛的守护神历代镇守于此。守护神其实也是人类，每一代只有一人，在接班时会喝下一杯玻璃瓶中倒出的酒红色液体，从此获得长生和超能力（如果不是候选守护神，则只能获得长生）。在预感自己寿命将尽时，守护神会召唤孕妇来到岛上，杀母夺子，独自抚养幼子，不让他/她与人类接触，免得受到人类污染，然后在自己死亡前将守护光源的责任交到他/她的手上，几千上万年以来一直如此。但这一切，在疯妈身上出现了意外。她召唤上岛的孕妇竟然生下了双胞胎，她中意的接班人小黑受到人类的蛊惑，逃离母亲与人类混居在一起，并时时刻刻想方设法逃离小岛。疯妈最后只能将守护重任交给了Jacob，而Jacob也不得不接下这个他原本并不情愿的责任。用剧中的话，疯妈和Jacob，don't have a choice。

从疯妈身上，Jacob吸取了两点教训。

一是从娃娃抓起并不靠谱。Jacob坚信人性本善，娃娃和成人并无不同，关键在于面临抉择时会作出怎样的选择。在遭遇亲人背叛、父母被害等种种人生逆境时，是否仍然能坚守本心，保持人性的光辉不灭。所以，他放弃了杀母夺子那种残忍的挑选接班人方式，改在人群中选择对象，进行引导，使其成长为能接受人性考验的合格的候选人。

二是要让彼此都“have a choice”,所以Jacob敲定了一堆候选人，让自己有更多的choice，也让候选人有说no的机会。

千百年来，Jacob和化身为黑烟怪的弟弟相互较劲，Jacob经常召唤人类来到岛上，进行他的社会学实验，试图以此证明给自己的弟弟小黑，告诉他他关于人性本恶的看法是错的。然而，由于Jacob坚持不干预政策，来到岛上的人类在小黑的屠杀和人类的自相残杀下，最终全部灭绝。

事情在1867年有了变化。这一年，黑岩号奴隶船从非洲西北部驶向美洲新大陆途中（航程全部位于大西洋，所以小岛那时的位置在大西洋，而不是太平洋），被召唤到了小岛，唯一的幸存者ricardo从Jacob那里得到一份工作，他将人类组织起来，成立了类似早期犹太人部落的准军事团体，敬仰Jacob如上帝，这就是“the others”。

1954年，美军无意中发现了这座小岛，小岛的神秘莫测让处于冷战期的美军高度紧张，于是发射了氢弹想将其摧毁，但由于有Jacob守护，氢弹并没有爆炸，the others将氢弹埋到了地下。

大约从五六十年代开始，Jacob预感到自己的寿命将尽，开始将挑选接班人计划提上日程。于是他出现在各位候选人的生活中，影响或引导他们的命运走向。Jacob开展这一计划是独立进行的，并没有告知the others。

70年代，达摩组织来到小岛上大搞基建，对小岛异常的电磁辐射进行研究。他们与当地土著the others爆发了冲突，然后又罕见地达成了停火协议。由此可见，达摩组织极有可能是Jacob召唤而来，因为没有Jacob的允许，达摩组织在小岛和人类世界间自由往来是不可想象的。而达摩与the others的停火协议，也应该是Jacob一力促成。但是，Jacob对于这两个组织却并非一视同仁。the others的成员在山林中穿梭从不用担心会受到黑烟怪的袭击，但达摩组织却需要在居住地外围建立一道音波屏障，用来阻隔黑烟怪。而且很显然，这道屏障对于the others是无效的，因为recardo就曾大摇大摆地穿过屏障，闯进达摩组织的居住地寻求谈判。

1977年，天鹅站施工地挖到异常磁场，随后引发一场氢弹爆炸事故（就是50年代美军投射的那颗氢弹），达摩组织遂在爆炸废墟上修建了天鹅站，并安排专人值守，每隔108分钟输入一串数字来释放超量的电磁波，那串数字就是充满神秘色彩的4 8 15 16 23 42。2004年9月22日，天鹅站值守人员Desmond外出跟踪同事导致错过了释放能量时间，从而引发了815航班的坠机，将本剧的主角们送来了这座小岛。

1987年，当时还在达摩的ben和the others联合展开了大清洗，团灭达摩组织。关于大清洗是否得到Jacob授意，我们不得而知。但至少表面上Jacob对此是无视的。大清洗后没过几年，ben通过内斗驱逐了charles wildmore，成为了the others的领袖。而charles wildmore不知通过什么方式，竟然建立了庞大的商业帝国，多年来一直资助各种航海航空活动，希望通过大海捞针的方式找到小岛。而最终他通过天鹅站里john locke阻止输入数字导致的电磁爆捕捉到了小岛的位置，从而引发了后来的货船上岛剧情，间接地将jack等6人送回了人类社会。

815er上岛后，经历了与法国女人、the others、黑烟、货船等各方势力的斗智斗勇，和团队内部的纷争、猜疑、分裂、生离死别，最终jack等6人乘坐直升机脱离了小岛的磁场范围，并被Desmond女友的搜寻船找到从而获救。而岛上的其它815er，则随着小岛在时空中穿梭，他们回到过50年代，也到过未来，还曾见到自己刚上岛时的情景，最终，时间定格在1974年，Sawyer等人加入了达摩组织，开始了全新的生活。这种时空穿梭有一个诡异之处，就是815er和货船上刚登岛的3人会被动进行时空穿梭，但the others则不会，所以就会出现一次时空穿梭完成后，原本聚在一起的815er和the others无法看见彼此，都觉得对方瞬间消失了，但其实，他们都还停留在原地，只是处在了不同的时间。

3年后的2007年，Jack等5人携带着John locke的遗体乘坐飞机返回小岛，但却进入了不同的时间线。Jack等人与留在岛上的815er一样，进入了1977年，而John locke因为已经死去，遗体随着航班的其它所有乘客一道，落在了2007年的小岛。

Jack等人刚上岛就搞了个大动作，于正在修建的天鹅仓工地引爆了氢弹，从而纠正了815er的时间线，他们重新回到了2007年，他们所处的时间点，应该恰好是Jacob被充满怨气的Ben杀害的时间。Jacob大概率精确地预言了自己的死亡时间，提前埋伏了两步棋，一是保镖Ilana，交给她的任务是保护剩下的5位候选人。二是charles wildmore，交给他的任务是对付黑烟怪。这两步棋也都不同程度地发挥了作用。尤其是charles wildmore带来了Desmond，能抗高辐射的他最终潜入光源，搬开了中央的石柱，使得黑烟怪成了肉体凡胎，最终被Jack和Kate联手消灭。

再说一下小岛光源的守护神传位仪式。疯妈传位给Jacob的时候，念了一段咒语，并且给他喝了一杯类似红酒的液体。当时那瓶红色液体已经没了将近一半，应该是被之前的历届守护神传承仪式给消费掉了。后来Jacob曾经给Recardo喝过一次，Recardo从此拥有长生不老之身。所以这瓶红酒的作用应该是长生，可能还有法力。剩下的那半瓶后来被黑烟怪打碎，导致Jacob传位给Jack时，已经无酒可用，只好用洗了手的溪水代替，好在他还会念那一段咒语。Jack上任后，我们并没有看到他有任何的神力。当Jack传位给Hugo时，只是随手从溪水里舀了半瓶水让Hugo喝下，没有红色液体，没有洗手过程，没有咒语，连容器都是充满现代工业色彩的矿泉水瓶。相信最后接班的Hugo仍然只是个凡人，没有法力，无法长生。所以我们可以看到，小岛守护神是越来越去神秘化，越来越世俗化的，像极了几乎所有宗教的成长历程。